Sau năm 1975, huyện Quế Sơn thuộc tỉnh Quảng Nam - Đà Nẵng, gồm 11 xã: Quế An, Quế Châu, Quế Hiệp, Quế Lộc, Quế Mỹ, Quế Phong, Quế Phú, Quế Phước, Quế Tân, Quế Thọ, Quế Xuân.

Ngày 23 tháng 9 năm 1981, Hội đồng Bộ trưởng ban hành quyết định số 79-HĐBT[4]. Theo đó:

• Chia xã Quế Phong thành hai xã lấy tên là xã Quế Phong và xã Quế Long
• Chia xã Quế Lộc thành hai xã lấy tên là xã Quế Lộc và xã Quế Trung
• Chia xã Quế Phước thành ba xã lấy tên là xã Quế Ninh, xã Quế Phước và xã Quế Lâm
• Chia xã Quế Tân thành ba xã lấy tên là xã Quế Bình, xã Quế Lưu và xã Quế Tân.

Ngày 1 tháng 12 năm 1983, Hội đồng Bộ trưởng ban hành quyết định số 141-HĐBT[5]. Theo đó:

• Chia xã Quế An thành hai xã lấy tên là Quế An và Quế Minh
• Chia xã Quế Mỹ thành hai xã lấy tên là xã Quế Mỹ và xã Quế Cường
• Chia xã Quế Hiệp thành hai xã lấy tên là xã Quế Hiệp và xã Quế Thuận.

Cuối năm 1984, huyện Quế Sơn có 20 xã: Quế An, Quế Bình, Quế Châu, Quế Cường, Quế Hiệp, Quế Lâm, Nông Sơn, Quế Lộc, Quế Long, Quế Lưu, Quế Minh, Quế Mỹ, Quế Ninh, Quế Phong, Quế Phú, Quế Phước, Quế Tân, Quế Thọ, Quế Thuận, Quế Trung, Quế Xuân.

Ngày 31 tháng 12 năm 1985, tách 4 xã: Quế Thọ, Quế Bình, Quế Lưu, Quế Tân để thành lập huyện Hiệp Đức.[6]

Huyện Quế Sơn còn lại 16 xã: Quế An, Quế Châu, Quế Cường, Quế Hiệp, Quế Lâm, Nông Sơn, Quế Lộc, Quế Long, Quế Minh, Quế Mỹ, Quế Ninh, Quế Phong, Quế Phú, Quế Phước, Quế Thuận, Quế Trung, Quế Xuân.

Ngày 11 tháng 1 năm 1986, thành lập thị trấn Đông Phú, thị trấn huyện lỵ huyện Quế Sơn trên cơ sở 884,29 ha diện tích tự nhiên với 5.281 nhân khẩu của xã Quế Châu và 243,1 ha diện tích tự nhiên với 1.084 nhân khẩu của xã Quế Long.[7]

Ngày 16 tháng 4 năm 1988, đổi tên xã Quế Mỹ thành xã Phú Thọ, thành lập xã mới tại khu kinh tế mới Nà Lau lấy tên là xã Quế Hội.[8]

Ngày 29 tháng 8 năm 1994, sáp nhập xã Quế Hội vào xã Quế Lâm.

Từ ngày 6 tháng 11 năm 1996, huyện Quế Sơn thuộc tỉnh Quảng Nam vừa tái lập.[9]

Ngày 12 tháng 1 năm 2004, chia xã Quế Xuân thành hai xã Quế Xuân 1 và Quế Xuân 2.[10]

Cuối năm 2007, huyện Quế Sơn có thị trấn Đông Phú và 17 xã: Quế An, Quế Châu, Quế Cường, Quế Hiệp, Quế Lâm, Quế Lộc, Quế Long, Quế Minh, Phú Thọ, Quế Ninh, Quế Phong, Quế Phú, Quế Phước, Quế Thuận, Quế Trung, Quế Xuân 1, Quế Xuân 2.

Ngày 8 tháng 4 năm 2008, Chính phủ ban hành Nghị định số 42/2008/NĐ-CP[11]. Theo đó:

• Thành lập xã Hương An trên cơ sở điều chỉnh 855 ha diện tích tự nhiên và 5.491 nhân khẩu của xã Quế Phú; 180 ha diện tích tự nhiên và 959 nhân khẩu của xã Quế Cường
• Thành lập xã Sơn Viên trên cơ sở điều chỉnh 2.517 ha diện tích tự nhiên và 3.215 nhân khẩu của xã Quế Lộc
• Thành lập xã Phước Ninh trên cơ sở điều chỉnh 8.298 ha diện tích tự nhiên và 2.130 nhân khẩu của xã Quế Phước; 3.930 ha diện tích tự nhiên và 1.456 nhân khẩu của xã Quế Ninh
• Tách 7 xã: Quế Lộc, Quế Trung, Quế Ninh, Quế Phước, Quế Lâm, Sơn Viên, Phước Ninh để thành lập huyện Nông Sơn

Huyện Quế Sơn còn lại thị trấn Đông Phú và 13 xã: Hương An, Phú Thọ, Quế An, Quế Châu, Quế Cường, Quế Hiệp, Quế Long, Quế Minh, Quế Phong, Quế Phú, Quế Thuận, Quế Xuân 1, Quế Xuân 2.

Ngày 10 tháng 1 năm 2020, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 863/NQ-UBTVQH14[12]. Theo đó:

• Sáp nhập xã Phú Thọ và xã Quế Cường thành xã Quế Mỹ
• Thành lập thị trấn Hương An trên cơ sở toàn bộ diện tích tự nhiên và dân số của xã Hương An.

Huyện Quế Sơn có 2 thị trấn và 11 xã như hiện nay.